Ovo ostrvo je jedno vreme bilo i nenaseljeno zbog čestih pretnji Turaka kao i pirata. Ceo region počinje da se naseljava kada su Mlečani u XV veku počeli da grade solane u slanim i plitkim vodama zaliva. Brojni napadi doveli su do toga da je bilo potrebno da se izgradi utvrđenje koje treba da bude konstruisano tako da bi najviše južne i severne strane ostrva imale fortifikacioni prsten kao i bastione koji su tu da bi sprečili iskrcavanje neprijatelja. Dobro postavljeno utvđenje je uspelo godinama da odoleva napadima Turaka koji su ipak na kraju uspeli da zauzmu Krit. Čak i nakon kraja vladavine Turaka, mnoge osmanlijske porodice su i dalje ostale na Spinalongi.
Spinalonga je bila napuštena u 20. veku i tada je postala poznata kao ostrvo gubavaca, jer su na njemu sve do 1957. godine (kada je pronažen lek za lepru/gubu) boravili gaubavci sa Krita i ostatka Grčke. Čuvena su na ulasku u tvrđavu “Danteova vrata” poznata po pravilu da jednom ko uđe živ, nikada iz tvrđave i ne izađe. Ovde su ljudi imali sve što im je potrebno za život, od svojih komuna, lekara, svih potrebnih namirnica. Kasnije je snimljena i serija “Ostrvo” koja dočarava ovo ostrvo i život ljudi na njemu. Ova serija inspirisala je mnoge da kroče na ovo tlo i da ono bude jedan od njihovih glavnih ciljeva posete Kritu.
Za dolazak do Spinalonge moguće je da krenete iz luka u mestima Elunda, Plaka ili Agios Nikolaos, a za brodiće ne morate da gledate red vožnje, jer idu na svakih 30-45 minuta. Vožnja brodićem ne traje dugo, kada se opustite i počnete da uživate, već ste tamo. Raširen kišobran vodiča će vam biti znak da ste stigli i da ga pratite jer su gužve uglavnom velike. Kada se iskrcate iz broda, priđete kućici kako bi kupili ulaznicu za tvrđavu koja košta oko 8 eur.
Obilazak zidina ostrva uz priču vodiča vam dočarava taj period na pravi način, pogotovo ako ste već čuli neku do priča ostrva pre dolaska, doživljaj je čaroban. Čućete priču o životu ljudi kojih se odvijao unutar zidina ovog utvrđenja, zaražene osobe su ovde vodile čak i lep život, toliko da je bilo onih koji su pokušavali da se dosele baš ovde. Popnite se obavezno na vrh bastiona kako bi uživali u čarobnom pogledu na okolinu i kako bi shvatili moć ovog utvrđenja kroz istoriju kakvo je bilo. U povratku, u zavisnosti od kompanije preko koje ste uplatili izlet, kao i od perioda godine, odvešće vas na kupanje na nekoj od plažica u okolini ili na primer na ručak u Elundu. Na kraju ovakav dan je svakako za pamćenje, od koračanja kroz istoriju vekovima unazad do tog neverovatnog plavetnila mora koje vas ni sekundu ne ostavlja.